“猪芯1号“-猪 51KSINE-RIP 液相芯片我要咨询 收藏本项目
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知识产权情况: 技术交易方式:技术服务 意向交易额:
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委托机构 技术经理人
项目名称 “猪芯1号“-猪 51KSINE-RIP 液相芯片 项目持有人 扬州大学
知识产权情况
项目所属领域
项目创新点
原理路线  “猪芯一号”由扬州大学宋成义课题组开发的,是世界首款基于 SINE 逆转座子插入多态位点(SINE-RIP)为基础的插入/缺失型结构变异芯片。SINE-RIP是一类长度主要集中在200bp-300bp的结构变异,且SINE 携带多种调控元件,较SNP 具有更加明显的遗传效应。该芯片是基于课题组自主研发的TypeSINE 程序,通过对包含中外不同猪种资源 350多个二代测序数据进行规模挖掘,获得超过 75 万个SINE 逆转座子插入多态位点,然后针对这些位点进行筛选和优化设计,制备成 SINE-RIP 液相芯片。该芯片包括51000个SINE-RIP 位点,均匀覆盖全基因组,位点选择上兼顾了商业化猪种和中国地方猪的遗传变异。该芯片具有批量、快速、准确、稳定性高等特点,可以用于猪的群体遗传学研究,种质资源鉴定,全基因组关联分析以及基因组选择育种。
成果成熟度:
该芯片具有通量高,自动化程度高,配备完全自主开发的基因分型程序。能够快速完成大批量样本的检测和分型国内工作。位点检出率超 95%,分型准确率超 90%。
应用领域和市场应用前景:
“猪芯一号”具有广泛的应用市场,可以在猪的群体遗传学研究,种质资源鉴定,全基因组关联分析以及基因组选择育种等方面发挥独特的作用。
合作方式:
技术授权,技术服务,技术开发
项目阶段
市场应用与前景 “猪芯一号”具有广泛的应用市场,可以在猪的群体遗传学研究,种质资源鉴定,全基因组关联分析以及基因组选择育种等方面发挥独特的作用。
技术交易方式 技术服务
意向交易额
备注
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