研发背景：

新发动物病原菌的快速检测与溯源对公共卫生健康安全具有重要的意义，基因测序相较传统的检测方法不仅保证了灵敏度，同时能进行病原菌的溯源。本项目依托新型便携实时测序的优势，制定了一套测序数据实时解析方案并搭建了计算机云分析平台，能够在6小时内准确鉴定各种致病病原菌，同时可对多种耐药病原菌进行溯源，为疾病的早期诊断和细菌基因组学研究带来了极大的便利，将会极大促进动物疫病的防控效率。

创新点：

（1）无需进行病原微生物培养，大大缩短了从采样到结果获取的时间。

（2）构建污染源DNA提取，测序文库构建，实时测序与分析一体化工作站。

（3）搭建了全面的病原体特征基因组数据库，病原体溯源基因库。共享病原菌鉴定生信分析云平台，可以实现测序数据实时产生、序列实时分析与结果实时产出。

关键指标：

（1）开发运用实时测序技术对病原菌进行快速检测与溯源的解决方案，并制定标准化流程，搭建云分析平台，将常规病原体感染检测时间缩短到6小时内。

（2）建立的云分析平台可降低数据分析门槛，且服务范围广泛。

（3）在现有的物种分类基础上，构建常见细菌、真菌、病毒病原体标记基因库，做到精准定位，靶向检测，提高检测效率。实现对病原体基因组的收集，重建及溯源。

软件著作权：

（1）fargo细菌耐药基因分析软件，扬州大学，2023.6.8，软著登字第11186354号

（2）单分子全基因组测序实时分析系统，扬州大学，2023.12.28，软著登字第12381968号